第一，工業(yè)廢水處理技術特別復雜。處理工藝的選擇需要考慮多個方面，包括污染企業(yè)的生產(chǎn)工藝。工業(yè)廢水處理工藝復雜，一些企業(yè)投資不足，無法妥善處理；一些企業(yè)已經(jīng)投入了足夠的資金，但由于后期管理不善，水量達不到標準，無法達到預期效果。

第二，工業(yè)廢水處理技術水平有限。從目前掌握的技術水平來看，我國許多工業(yè)廢水處理理論上無法達到標準。

第三，中國的經(jīng)濟還不太發(fā)達，不僅廢水難以處理，而且對經(jīng)濟貢獻巨大的高產(chǎn)量污染企業(yè)也將繼續(xù)存在。就制藥行業(yè)而言，中國許多制藥廠都是初級制藥公司，有大量的污染生產(chǎn)。

第四，工業(yè)園區(qū)污水處理問題。工業(yè)園區(qū)的初衷是集中處理工業(yè)廢水，但在現(xiàn)實中，它產(chǎn)生了新的問題。

第五，“負面影響”問題。一些污染企業(yè)不想在廢水處理上投入太多資金，逐利企業(yè)仍有這種觀念。他們認為，工業(yè)廢水的處理除了滿足環(huán)保部門的檢查以避免處罰外，沒有任何好處，反而增加了成本。

第六，市場混亂問題。承擔工業(yè)廢水處理項目的污染治理企業(yè)“環(huán)保公司”可謂魚龍混雜。因此，行業(yè)內(nèi)形成了惡性競爭，導致一些曾經(jīng)致力于工業(yè)廢水領域的公司在面臨機遇時轉型。

第七，規(guī)模效應問題。許多工業(yè)廢水處理項目訂單不足，與城市污水處理相比，難以形成規(guī)模效應和產(chǎn)生大型企業(yè)。盡管在這一領域有優(yōu)秀的環(huán)保公司，但很難像市政污水處理企業(yè)那樣實現(xiàn)數(shù)百萬甚至數(shù)千萬噸的日處理規(guī)模。

第八，商業(yè)模式問題。每個環(huán)保公司都有獨特的生存方式，但主要模式仍然是“設計、采購、施工”，其他普遍適用的商業(yè)模式仍在探索中。

第九，零排放誤解。多年來，中國一直在實施工業(yè)廢水零排放處理，但在現(xiàn)實中，無法實現(xiàn)真正的零排放，目前中國也沒有完美的零排放案例。

第十，排放標準執(zhí)行困難和監(jiān)管松懈。缺乏嚴格監(jiān)管、“一刀切”、脫離實際是一些行業(yè)難以執(zhí)行排放標準的主要原因，工業(yè)廢水處理行業(yè)也面臨類似問題。